La autoinmunidad es una alteración en el sistema inmunitario por el que éste reacciona contra un tipo celular o una proteína propia del organismo. Es causada por fallos del sistema inmune que provocan que se formen autoantígenos y células autorreactivas.

Se debe generalmente a factores genéticos y ambientales y hay mayor prevalencia en el sexo femenino que en el masculino.

Una de las causas de las enfermedades autoinmunes es la similitud entre algunos antígenos y proteínas del organismo, por lo que los linfocitos activados frente a estos antígenos reaccionan frente a estas proteínas del propio cuerpo.

En otras ocasiones se debe a que algunas proteínas están en zonas muy distantes de los órganos linfoides y no se han desarrollado mecanismos de tolerancia frente a ellas.

Otra causa radica en que hay linfocitos T y B autorreactivos que no son eliminados en el desarrollo del sistema inmune y provocan respuestas autoinmunes.

Algunos ejemplos de enfermedades autoinmunes son: la esclerosis múltiple, el lupus eritematoso, la psoriasis o la esclerosis lateral amiotrófica.