Otros caracteres presentan codominancia; es decir. los híbridos manifiestan los dos fenotipos correspondientes a los dos alelos diferentes que poseen. Por ejemplo, en algunas variedades de pollos los híbridos resultantes del cruce de gallinas de plumaje negro (NN) con gallos de plumas blancas (nn), tienen plumas de ambos colores. Más adelante veremos otro ejemplo de codominancia en el estudio de los grupos sanguíneos, ya que las personas de grupo sanguíneo AB presentan simultáneamente características de los grupos llamados A y B.

En los casos de herencia intermedia y codominante se cumplen las leyes de Mendel, aunque aparecen fenotipos nuevos que distorsionan las proporciones de los mismos. Por convenio, se sigue utilizando la misma letra para los dos alelos que rigen el carácter, aunque se puede designar con mayúscula a cualquiera de ellos ya que no hay dominancia ni recesividad.