En cuanto a pasajeros, el puerto más transitado es el de Baleares (Palma de Mallorca) que concentra el tráfico de ferrys entre las Baleares y la península, entre las propias islas y que es punto de salida y escala en los viajes de cruceros.

Le siguen el puerto de Algeciras, que concentra una parte muy importante del tráfico entre la península y las ciudades españolas del norte de África (y desde estas con Marruecos, Argelia, etc.), y el de Santa Cruz de Tenerife, que también se encuentra en las líneas de ferry entre las islas, además de situarse como punto de salida y escala de cruceros.

Luego, ya con menores cifras, se encuentran Barcelona, Ceuta y Almería. El resto de los puertos tienen un tráfico de pasajeros mucho menor. Los tres primeros puertos concentran el 62% de todo el tráfico de pasajeros de los puertos españoles, y los cinco primeros, el 87%.

En cuanto al tráfico de mercancías, el principal puerto español es el de Algeciras, que realiza el 15% del total español. Se trata de un puerto especializado en el transporte entre el norte de África y la península, y desde esta hacia el resto de Europa occidental.

Le siguen Valencia y Barcelona, con cifras similares, que suponen algo más del 10% del total nacional. Detrás se encuentran Bilbao y Tarragona, con el 8,3% y el 7%, respectivamente.

Estos cuatro puertos presentan una gran diversidad de orígenes y destinos para sus mercancías, aunque predominan las ciudades europeas. El conjunto de estos cuatro puertos supone el 52% del tráfico total de mercancías en los puertos españoles.